20 декабря 1991 года он был избран первым президентом Республики Саха (Якутия).
С 2002 года перешел на работу в Совет Федерации РФ, был заместителем Председателя СФ. Также Николаев М.Е. был депутатом Госдумы VI созыва.
Михаил Ефимович, занимая высокие посты, внес большой вклад в развитие кооперации в России, в том числе кредитной кооперации. Он понимал сущность и ценность кооперации, ратовал за консолидацию всех видов кооперации во благо развития территорий России.
Лига кредитных союзов благодарна за поддержку, которую получала от Михаила Ефимовича в решении вопросов развития кредитной кооперации в России.
Высоко ценим и дорожим сотрудничеством с человеком, который думал о людях и служил им.
Выражаем глубокое соболезнование родным и близким Михаила Ефимовича.